2021年9月，复旦大学附属华山医院李圣青教授担任通讯作者，在《BioMed research international》上发表研究论文《Diagnostic Accuracy of Metagenomic Next-Generation Sequencing in Sputum-Scarce or Smear-Negative Cases with Suspected Pulmonary Tuberculosis》。纳入107例疑似肺结核患者进行分析(图1)，探究了mNGS对无痰或涂片阴性的疑似肺结核患者BALF或肺活检标本的诊断准确性。

图1：基于T-SPOT.TB试验的患者纳入标准的分类

结果显示，107例患者中，46例诊断为肺结核(PTB)，61例诊断为非肺结核(non-PTB)。两组之间在年龄、BMI和T-SPOT.TB检测阳性率上差异显著。PTB组平均年龄、BMI均显著低于non-PTB组，提示年龄和BMI是肺结核的危险因素。PTB组T-SPOT.TB阳性率明显高于non-PTB组，强调了对T-SPOT.TB阳性患者进行常规肺结核筛查的必要性(表1)。

表1：受试者临床特征

在对肺结核的诊断性能方面(表2)，mNGS的敏感性为89.13%，高于常规检测(67.39%)，但与T-SPOT.TB单独检测(76.09%)或T-SPOT.TB联合常规检测(91.30%)相当。此外，mNGS的特异性为98.36%，与常规检测(95.08%)相似，但明显高于T-SPOT.TB单独检测(65.57%)或T-SPOT.TB联合常规检测(63.93%)。

mNGS的阳性预测值(PPV)和阴性预测值(NPV)分别为97.62%和92.31%，而常规检测的PPV和NPV分别为91.18%和79.45%。相比之下，T-SPOT.TB的PPV和NPV分别为62.50%和78.43%，T-SPOT.TB联合常规检测的PPV和NPV分别为65.63%和90.70%。

表2：mNGS、常规检测、T-SPOT.TB对肺结核的检测性能

受试者工作特征(ROC)曲线显示，mNGS的曲线下面积(0.929)大于其他方法的曲线下面积(图2)，表明mNGS比常规检测或TSPOT.TB检测对疑似肺结核的诊断准确率更高。

进一步分析显示，BALF和肺组织活检类型标本mNGS检测的敏感性相似、特异性无显著差异。BALF mNGS的PPV和NPV分别为96.67%和93.75%，而肺组织活检标本mNGS的PPV和NPV分别为92.31%和87.5% (表3)。这表明，mNGS的诊断准确率与样本类型无关。因此，在诊断肺结核时，尤其是在有禁忌症的情况下，BALF和肺组织活检标本可相互替换。

图2：不同检测技术的诊断准确性

表3：mNGS在BALF和肺组织活检标本中的诊断价值

综上，这项研究表明，mNGS可以在痰稀少或涂片阴性的疑似肺结核病例的BALF或肺组织活检标本中更好地检测结核分枝杆菌。

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原文链接：Diagnostic Accuracy of Metagenomic Next-Generation Sequencing in Sputum-Scarce or Smear-Negative Cases with Suspected Pulmonary Tuberculosis